Covid-19 pool testing
“Tenemos un mensaje simple para todos los países: test, test, test.” -Dr. Tedros Adhanom Ghebreyesus, Director General de la Organización Mundial de la Salud
“Tenemos un mensaje simple para todos los países: test, test, test.” -Dr. Tedros Adhanom Ghebreyesus, Director General de la Organización Mundial de la Salud
El proyecto "Covid-19 Pool Testing" tiene como objetivo aumentar el número de tests de Coronavirus realizados utilizando la menor cantidad posible de kits de testeo, insumo muy escaso en este momento de la pandemia. Los países deben aumentar el número de tests y multiplicar el aislamiento y los esfuerzos de rastreo de contactos. Se debe testear a cada caso sospechoso, y si da positivo, aislarlo y averiguar quienes son sus contactos en los días previos para testear a esas personas también.
Fundamentos:
Es posible realizar tests para Covid-19 a varias personas simultáneamente ("pool testing" o testeo conjunto).
El riesgo a priori de infección por Covid-19 puede estimarse a partir de datos clínicos y epidemiológicos del paciente. Las muestras de personas con bajo riesgo a priori de infección pueden analizarse de manera conjunta.
En la estrategia "Covid-19 Pool Testing" se genera un protocolo de testeo que agrupa a las muestras por el riesgo de infección y se testean de manera conjunta. Si el test conjunto de un grupo de personas da negativo, sabemos que ninguna persona de ese grupo está infectada. De esta manera ahorramos kits, ya que no debemos usar un kit por cada personas del grupo. Si, en cambio, el test conjunto da positivo, sabemos que al menos 1 persona del grupo está infectada. En este caso, se repite el proceso, generando nuevos conjuntos de muestras agrupadas, hasta indentificar individualmente a los infectados.
Utilizando "Covid-19 pool testing", de acuerdo al riesgo a priori de infección por Covid-19 de las personas testeadas, se puede multiplicar la utilidad de los tests en 2,65 veces (5% de riesgo a priori) o hasta 21,75 veces (0,1% de riesgo a priori).
Estrategia pool testing:
¿Qué problemas queremos abordar con este proyecto?
Registro de antecedentes clinicos y epidemiológicos
Recabar los datos de manera estandarizada para poder estimar riesgo a priori de infección por Covid-19
Alcance del proyecto:
Generar software o adaptar existente para registrar los datos sin ambigüedades y sin errores
Estimacion de riesgo a priori
Estimar el riesgo de infección de COVID-19 a priori utilizando datos clínicos y epidemiológicos
Alcance del proyecto:
Integrar modelos existentes de Machine Learning para estimacion de probabilidad a priori.
Generación de protocolos de pool testing
Generar protocolos de pool testing (como agrupar las pruebas) de acuerdo a riesgo a priori de infección y limitaciones de los laboratorios (máxima cantidad de tests simultáneos, máxima cantidad de tests por persona, tiempo máximo esperado)
Alcance del proyecto:
Software que genera protocolo de pool testing de acuerdo a la probabilidad a priori de las muestras.
Testing
Generar instructivos aplicables en equipamiento existente para realizar pool testing.
Alcance del proyecto:
Estudiar distintas tecnicas de testeo para generar los instructivos.
Resolución los problemas practicos que lleva pool testing.
Asegurar factibilidad tecnica de las propuestas.
Políticas de salud
Desarrollo de políticas de contención de acuerdo a la mayor capacidad de testeo
Si estas interesado en formar parte del grupo de trabajo, podes ver que estamos haciendo en esta pagina.